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Development v1.0.0

lobster-bio-dev

ClawHub

开发、扩展并贡献于 Lobster AI——多智能体生物信息学引擎 在处理 Lobster 代码库、创建智能体或服务、理解架构、修复漏洞、添加功能或参与开源项目时使用 触发短语:add agent、create service、extend lobster、contribute、understand architecture、how does X work in lobster、fix bug、add feature、write tests、lobster development、agent development、bioinformatics code

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Research & Science v1.0.0

biopython

Antigravity

全面的分子生物学工具包,用于序列操作、文件解析(FASTA/GenBank/PDB)、系统发育分析以及程序化访问NCBI/PubMed(Bio.Entrez)。最适合批量处理、自定义生物信息学流程和BLAST自动化。如需快速查询,请使用gget

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Research & Science v1.0.0

bioskills

ClawHub

安装涵盖序列分析、RNA测序、单细胞分析、变异检测、宏基因组学、结构生物学等56个以上类别的425种生物信息学技能。在搭建生物信息学能力或执行需要尚未安装的特殊技能的生物信息学任务时使用。

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Research & Science v1.0.0

biopython

K-Dense Inc.

全面的分子生物学工具包。用于序列操作、文件解析(FASTA/GenBank/PDB)、系统发育分析以及编程访问NCBI/PubMed(Bio.Entrez)。最适合批量处理、自定义生物信息学流程和BLAST自动化。如需快速查询,请使用gget;如需多服务集成,请使用bioservices。

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Research & Science v1.0.0

bioservices

K-Dense Inc.

统一的 Python 接口,支持 40 多个生物信息学服务。在单个工作流中查询多个数据库(UniProt、KEGG、ChEMBL、Reactome)时使用,API 保持一致。最适合跨数据库分析和跨服务的 ID 映射。如需快速单数据库查询,请使用 gget;如需序列或文件操作,请使用 biopython。

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Research & Science v1.0.0

dnanexus-integration

K-Dense Inc.

DNAnexus 云基因组学平台。构建应用程序/小程序、管理数据(上传/下载)、使用 dxpy Python SDK、运行工作流,支持 FASTQ/BAM/VCF 格式,用于基因组学管道的开发与执行。

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Research & Science v1.0.0

ena-database

K-Dense Inc.

通过API/FTP访问欧洲核苷酸档案库,按 accession 获取DNA/RNA序列、原始测序数据(FASTQ)和基因组组装结果,用于基因组学和生物信息学流程。支持多种格式。

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Research & Science v1.0.0

对超过200种文件格式的科学数据文件进行全方位的探索性数据分析。该技能适用于分析任何科学数据文件,以理解其结构、内容、质量与特征。自动识别文件类型,并生成包含格式特定分析、质量指标及下游分析建议的详细Markdown报告。覆盖化学、生物信息学、显微镜、光谱学、蛋白质组学、代谢组学及通用科学数据格式。

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Research & Science v1.0.0

gget

K-Dense Inc.

快速通过 CLI/Python 查询 20 多个生物信息学数据库,用于快速查找:基因信息、BLAST 搜索、AlphaFold 结构、富集分析。最适合交互式探索和简单查询。如需批处理或高级 BLAST 功能,请使用 Biopython;如需多数据库 Python 工作流,请使用 Bioservices。

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