安装涵盖序列分析、RNA测序、单细胞分析、变异检测、宏基因组学、结构生物学等56个以上类别的425种生物信息学技能。在搭建生物信息学能力或执行需要尚未安装的特殊技能的生物信息学任务时使用。

查询 cBioPortal 获取癌症基因组数据，包括数千项癌症研究中的体细胞突变、拷贝数变异、基因表达和生存数据，用于癌症靶点验证、癌基因/抑癌基因分析及患者层面的基因组谱分析。

访问ClinPGx药物基因组学数据（PharmGKB的后继者），查询基因-药物相互作用、CPIC指南和等位基因功能，以支持精准医学和基因型指导的给药决策。

DNAnexus 云基因组学平台。构建应用程序/小程序、管理数据（上传/下载）、使用 dxpy Python SDK、运行工作流，支持 FASTQ/BAM/VCF 格式，用于基因组学管道的开发与执行。

通过API/FTP访问欧洲核苷酸档案库，按 accession 获取DNA/RNA序列、原始测序数据（FASTQ）和基因组组装结果，用于基因组学和生物信息学流程。支持多种格式。

查询Ensembl基因组数据库REST API，涵盖250多种物种，支持基因检索、序列获取、变异分析、比较基因组学、直系同源基因分析和VEP预测，适用于基因组研究。

系统发育树工具包（ETE）：支持树形结构操作（Newick/NHX）、进化事件检测、直系同源与旁系同源分析、NCBI分类学、可视化（PDF/SVG），适用于系统基因组学。

访问NCBI GEO获取基因表达/基因组学数据。搜索/下载微阵列和RNA-seq数据集（GSE、GSM、GPL），获取SOFT/矩阵文件，用于转录组学和表达分析。

一个用 Rust 编写的高性能基因组区间分析工具包，附带 Python 绑定。适用于处理基因组区域、BED 文件、覆盖度轨迹、重叠检测、机器学习模型的分词，或计算基因组学和机器学习应用中的片段分析。