深度学习框架(PyTorch Lightning)。将PyTorch代码组织为LightningModules,配置训练器以支持多GPU/TPU,实现数据管道、回调函数、日志记录(W&B、TensorBoard)以及分布式训练(DDP、FSDP、DeepSpeed),以实现可扩展的神经网络训练。
深度学习框架(PyTorch Lightning)。将PyTorch代码组织为LightningModules,配置训练器以支持多GPU/TPU,实现数据管道、回调函数、日志记录(W&B、TensorBoard)以及分布式训练(DDP、FSDP、DeepSpeed),以实现可扩展的神经网络训练。
标准单细胞RNA测序分析流程。适用于质量控制、归一化、降维(PCA/UMAP/t-SNE)、聚类、差异表达分析和可视化。最适合采用成熟工作流程的探索性单细胞RNA测序分析。如需使用深度学习模型,请使用scvi-tools;如有关于数据格式的问题,请使用anndata。
使用 scikit-learn 在 Python 中进行机器学习。适用于处理监督学习(分类、回归)、无监督学习(聚类、降维)、模型评估、超参数调优、数据预处理或构建机器学习流水线。提供算法、预处理技术、流水线和最佳实践的全面参考文档。
用于单细胞组学的深度生成模型。当需要概率性批次校正(scVI)、迁移学习、带不确定性差异表达分析或多模态整合(TOTALVI、MultiVI)时使用。最适合高级建模、批次效应和多模态数据。标准分析流程请使用scanpy。
使用此技能处理和分析超出可用内存的大型表格数据集(数十亿行)。Vaex 在外部存储 DataFrame 操作、惰性求值、快速聚合、大数据高效可视化以及大规模数据集的机器学习方面表现卓越。当用户需要处理大型 CSV/HDF5/Arrow/Parquet 文件、对海量数据集进行快速统计分析、创建大数据可视化图表,或构建无法完全装入内存的机器学习流水线时,适用于此场景。
用于云存储的分块 N 维数组,支持压缩、并行 I/O、S3/GCS 集成,兼容 NumPy/Dask/Xarray,适用于大规模科学计算流程。
当电子表格文件是主要输入或输出时,使用此技能。这意味着用户需要执行以下任何任务:打开、读取、编辑或修复现有的 .xlsx、.xlsm、.csv 或 .tsv 文件(例如,添加列、计算公式、格式化、制图、清理杂乱数据);从零开始或从其他数据源创建新的电子表格;或在表格文件格式之间进行转换。当用户提及电子表格文件的名称或路径时(即使只是随意提及,如“我下载文件夹里的那个 xlsx”),并希望对其执行操作或基于它生成内容时,应触发此技能。此外,当需将杂乱的表格文件(如格式错误的行、错位的表头、垃圾数据)清理并重构为规范的电子表格时,也应触发此技能。交付物必须是电子表格文件。若主要交付物是 Word 文档、HTML 报告、独立的 Python 脚本、数据库流水线或 Google Sheets API 集成,即便涉及表格数据,也请勿触发此技能。