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Research & Science v1.0.0

biopython

K-Dense Inc.

全面的分子生物学工具包。用于序列操作、文件解析(FASTA/GenBank/PDB)、系统发育分析以及编程访问NCBI/PubMed(Bio.Entrez)。最适合批量处理、自定义生物信息学流程和BLAST自动化。如需快速查询,请使用gget;如需多服务集成,请使用bioservices。

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gget

K-Dense Inc.

快速通过 CLI/Python 查询 20 多个生物信息学数据库,用于快速查找:基因信息、BLAST 搜索、AlphaFold 结构、富集分析。最适合交互式探索和简单查询。如需批处理或高级 BLAST 功能,请使用 Biopython;如需多数据库 Python 工作流,请使用 Bioservices。

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modal

K-Dense Inc.

在云端使用无服务器容器、GPU 和自动扩缩容运行 Python 代码。适用于部署机器学习模型、运行批处理任务、调度计算密集型任务,或提供需 GPU 加速或动态扩缩容的 API。

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pubmed-database

K-Dense Inc.

直接通过 REST API 访问 PubMed。支持高级布尔/MeSH 查询、E-utilities API、批量处理和引文管理。适用于 Python 工作流时,建议使用 BioPython(Bio.Entrez)。本工具适用于直接的 HTTP/REST 操作或自定义 API 实现。

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