查询JASPAR以获取转录因子结合位点（TFBS）特征（PWMs/PFMs）。可通过转录因子名称、物种或类别进行搜索；扫描DNA序列以查找转录因子结合位点；比较基质矩阵；对调控基因组学、基序分析和GWAS调控变异解释至关重要。

查询Open Targets平台，以获取靶标-疾病关联、药物靶标发现、可成药性/安全性数据、遗传学/组学证据、已知药物，用于治疗靶标识别。

使用MAFFT（多重序列比对）、IQ-TREE 2（最大似然法）和FastTree（快速NJ/ML）构建与分析系统发育树，并通过ETE3或FigTree进行可视化。适用于进化分析、微生物基因组学、病毒系统动力学、蛋白家族分析及分子钟研究。

使用 TileDB 高效存储和检索基因组变异数据，支持可扩展的 VCF/BCF 数据导入、增量样本添加、压缩存储、并行查询以及群体基因组学的导出功能。