Google NotebookLM 的自托管开源替代品，支持AI驱动的研究与文档分析。适用于将研究资料整理成笔记本、导入多种内容来源（PDF、视频、音频、网页、Office文档），生成AI驱动的笔记与摘要，从研究内容创建多说话者播客，通过上下文感知AI与文档对话，利用全文和向量搜索跨材料检索，或运行自定义内容转换。支持包括OpenAI、Anthropic、Google、Ollama、Groq和Mistral在内的16种以上AI服务商，并通过自托管确保完全的数据隐私。

使用OpenAlex数据库查询和分析学术文献。当需要搜索学术论文、分析研究趋势、查找作者或机构的作品、追踪引用、发现开放获取出版物或对超过2.4亿篇学术作品进行文献计量分析时，请使用本技能。适用于文献检索、研究成果分析、引用分析和学术数据库查询。

功能全面的计算病理学工具包，适用于高级WSI分析，包括多重免疫荧光（CODEX、Vectra）、细胞核分割、组织图构建以及病理数据的机器学习模型训练。支持160多种切片格式。如需从H&E切片中简单提取图像块，histolab可能更便捷。

使用MAFFT（多重序列比对）、IQ-TREE 2（最大似然法）和FastTree（快速NJ/ML）构建与分析系统发育树，并通过ETE3或FigTree进行可视化。适用于进化分析、微生物基因组学、病毒系统动力学、蛋白家族分析及分子钟研究。

交互式可视化库。当您需要悬停信息、缩放、平移或可嵌入网页的图表时使用。最适合用于仪表盘、探索性分析和演示。如需静态出版图表，请使用 matplotlib 或科学可视化工具。

差异基因表达分析（Python DESeq2）。从批量RNA-seq计数中识别差异表达基因，使用Wald检验、FDR校正，生成火山图和MA图，用于RNA-seq分析。

用于处理DICOM（医学数字成像和通信）文件的Python库。当需要读取、写入或修改DICOM格式的医学影像数据，从医学影像（CT、MRI、X射线、超声）中提取像素数据，匿名化DICOM文件，处理DICOM元数据和标签，将DICOM图像转换为其他格式，处理压缩的DICOM数据，或处理医学影像数据集时，可使用此技能。适用于涉及医学影像分析、PACS系统、放射科工作流程和医疗影像应用的任务。

完整的质谱分析平台，适用于蛋白质组学工作流程中的特征检测、肽段鉴定、蛋白质定量和复杂的液相色谱-串联质谱（LC-MS/MS）流程。支持多种文件格式和算法，最适合蛋白质组学和全面的质谱数据处理。如需简单的谱图比较或代谢物鉴定，请使用matchms。

查询 Reactome REST API 以进行通路分析、富集分析、基因-通路映射、疾病通路、分子互作和表达分析，用于系统生物学研究。