基于扩散的分子对接。从PDB/SMILES预测蛋白质-配体结合构象、置信度分数和虚拟筛选,用于基于结构的药物设计。不用于亲和力预测。
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DNAnexus 云基因组学平台。构建应用程序/小程序、管理数据(上传/下载)、使用 dxpy Python SDK、运行工作流,支持 FASTQ/BAM/VCF 格式,用于基因组学管道的开发与执行。
访问并分析DrugBank数据库中的全面药物信息,包括药物性质、相互作用、靶点、通路、化学结构和药理数据。当处理药物数据、药物发现研究、药理学研究、药物-药物相互作用分析、靶点鉴定、化学相似性搜索、ADMET预测,或任何需要从DrugBank获取详细药物及药物靶点信息的任务时,应使用此功能。
用于访问、分析和提取SEC EDGAR申报文件数据的Python库。适用于处理SEC申报文件、财务报表(利润表、资产负债表、现金流量表)、XBRL财务数据、内幕交易(4号表格)、机构持股(13F表格)、公司财务信息、年度/季度报告(10-K、10-Q)、委托书(DEF 14A)、8-K重大事件、按股票代码/CIK/行业筛选公司、多期财务分析或任何SEC监管申报文件。
通过API/FTP访问欧洲核苷酸档案库,按 accession 获取DNA/RNA序列、原始测序数据(FASTQ)和基因组组装结果,用于基因组学和生物信息学流程。支持多种格式。
查询Ensembl基因组数据库REST API,涵盖250多种物种,支持基因检索、序列获取、变异分析、比较基因组学、直系同源基因分析和VEP预测,适用于基因组研究。
一套全面的蛋白质语言模型工具包,包含ESM3(跨序列、结构和功能的生成性多模态蛋白质设计)和ESM C(高效蛋白质嵌入与表示)。在处理蛋白质序列、结构或功能预测、设计新型蛋白质、生成蛋白质嵌入、执行逆向折叠或开展蛋白质工程任务时使用此工具。支持本地模型使用和基于云的Forge API以实现可扩展推理。
系统发育树工具包(ETE):支持树形结构操作(Newick/NHX)、进化事件检测、直系同源与旁系同源分析、NCBI分类学、可视化(PDF/SVG),适用于系统基因组学。
对超过200种文件格式的科学数据文件进行全方位的探索性数据分析。该技能适用于分析任何科学数据文件,以理解其结构、内容、质量与特征。自动识别文件类型,并生成包含格式特定分析、质量指标及下游分析建议的详细Markdown报告。覆盖化学、生物信息学、显微镜、光谱学、蛋白质组学、代谢组学及通用科学数据格式。