通过API/FTP访问欧洲核苷酸档案库，按 accession 获取DNA/RNA序列、原始测序数据（FASTQ）和基因组组装结果，用于基因组学和生物信息学流程。支持多种格式。

查询Ensembl基因组数据库REST API，涵盖250多种物种，支持基因检索、序列获取、变异分析、比较基因组学、直系同源基因分析和VEP预测，适用于基因组研究。

一套全面的蛋白质语言模型工具包，包含ESM3（跨序列、结构和功能的生成性多模态蛋白质设计）和ESM C（高效蛋白质嵌入与表示）。在处理蛋白质序列、结构或功能预测、设计新型蛋白质、生成蛋白质嵌入、执行逆向折叠或开展蛋白质工程任务时使用此工具。支持本地模型使用和基于云的Forge API以实现可扩展推理。

分析并工程化蛋白质糖基化。扫描序列中的N-糖基化位点（N-X-S/T），预测O-糖基化热点，并访问经过整理的糖工程工具（NetOGlyc、GlycoShield、GlycoWorkbench），用于糖蛋白工程、治疗性抗体优化和疫苗设计。

查询JASPAR以获取转录因子结合位点（TFBS）特征（PWMs/PFMs）。可通过转录因子名称、物种或类别进行搜索；扫描DNA序列以查找转录因子结合位点；比较基质矩阵；对调控基因组学、基序分析和GWAS调控变异解释至关重要。

访问 RCSB PDB 获取三维蛋白质/核酸结构。通过文本、序列或结构进行搜索，下载坐标（PDB/mmCIF），检索元数据，用于结构生物学和药物发现。

使用MAFFT（多重序列比对）、IQ-TREE 2（最大似然法）和FastTree（快速NJ/ML）构建与分析系统发育树，并通过ETE3或FigTree进行可视化。适用于进化分析、微生物基因组学、病毒系统动力学、蛋白家族分析及分子钟研究。

基因组文件工具包。读取/写入SAM/BAM/CRAM比对结果、VCF/BCF变异、FASTA/FASTQ序列，提取区域，计算覆盖度，适用于NGS数据处理流程。

生物数据工具包。用于微生物组分析的序列分析、比对、系统发育树、多样性指标（α/β、UniFrac）、排序（PCoA）、PERMANOVA、FASTA/Newick 输入/输出。