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arboreto

K-Dense Inc.

使用可扩展算法(GRNBoost2、GENIE3)从基因表达数据中推断基因调控网络(GRNs)。在分析转录组数据(批量RNA测序、单细胞RNA测序)时使用,以识别转录因子与靶基因的关系及调控相互作用。支持大规模数据集的分布式计算。

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biorxiv-database

K-Dense Inc.

适用于 bioRxiv 预印本服务器的高效数据库检索工具。在通过关键词、作者、日期范围或类别搜索生命科学类预印本、获取论文元数据、下载 PDF 或进行文献综述时使用此功能。

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cirq

K-Dense Inc.

谷歌量子计算框架。适用于针对谷歌量子AI硬件、设计考虑噪声的电路或运行量子表征实验。最适合谷歌硬件、噪声建模和底层电路设计。对于IBM硬件,请使用Qiskit;对于使用自动微分的量子机器学习,请使用PennyLane;对于物理模拟,请使用QuTiP。

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citation-management

K-Dense Inc.

用于学术研究的全面文献管理。搜索Google Scholar和PubMed中的论文,提取准确的元数据,验证引用信息,并生成格式正确的BibTeX条目。当您需要查找论文、核实引用信息、将DOI转换为BibTeX格式,或确保科学写作中参考文献的准确性时,请使用本功能。

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Research & Science v1.0.0

为制药和临床研究环境生成专业的临床决策支持(CDS)文档,包括患者队列分析(按生物标志物分层并结合结局)和治疗推荐报告(基于证据的指南与决策算法)。支持GRADE证据分级、统计分析(风险比、生存曲线、瀑布图)、生物标志物整合及监管合规性。输出专为药物研发、临床研究和证据综合优化的可直接发表的LaTeX/PDF格式。

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gene-database

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通过E-utilities/Datasets API查询NCBI Gene。按符号/ID搜索,获取基因信息(RefSeq、GO、位置、表型),支持批量查询,用于基因注释和功能分析。

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geomaster

K-Dense Inc.

涵盖遥感、GIS、空间分析、地球观测机器学习及30多个科学领域的综合地理空间科学技能。支持卫星影像处理(哨兵、陆地卫星、MODIS、SAR、高光谱)、矢量与栅格数据操作、空间统计、点云处理、网络分析、云原生工作流(STAC、COG、Planetary Computer),并支持8种编程语言(Python、R、Julia、JavaScript、C++、Java、Go、Rust),提供500多个代码示例。适用于遥感工作流、GIS分析、空间机器学习、地球观测数据处理、地形分析、水文建模、海洋空间分析、大气科学及任何地理空间计算任务。

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ginkgo-cloud-lab

K-Dense Inc.

在Ginkgo Bioworks云实验室(cloud.ginkgo.bio)上提交和管理协议,该平台是一个基于网页的界面,用于在可重构自动化推车(RACs)上实现自主实验。当用户需要运行无细胞蛋白质表达(验证或优化)、生成荧光像素艺术或与Ginkgo云实验室服务交互时使用。涵盖协议选择、输入准备、定价和订购流程。

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