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gget

K-Dense Inc.

快速通过 CLI/Python 查询 20 多个生物信息学数据库,用于快速查找:基因信息、BLAST 搜索、AlphaFold 结构、富集分析。最适合交互式探索和简单查询。如需批处理或高级 BLAST 功能,请使用 Biopython;如需多数据库 Python 工作流,请使用 Bioservices。

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ginkgo-cloud-lab

K-Dense Inc.

在Ginkgo Bioworks云实验室(cloud.ginkgo.bio)上提交和管理协议,该平台是一个基于网页的界面,用于在可重构自动化推车(RACs)上实现自主实验。当用户需要运行无细胞蛋白质表达(验证或优化)、生成荧光像素艺术或与Ginkgo云实验室服务交互时使用。涵盖协议选择、输入准备、定价和订购流程。

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gnomad-database

K-Dense Inc.

查询gnomAD(基因组聚集数据库)以获取人群等位基因频率、变异约束评分(pLI、LOEUF)及功能丧失不耐受信息。对于变异致病性解读、罕见病遗传学研究以及识别功能丧失不耐受基因至关重要。

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gtars

K-Dense Inc.

一个用 Rust 编写的高性能基因组区间分析工具包,附带 Python 绑定。适用于处理基因组区域、BED 文件、覆盖度轨迹、重叠检测、机器学习模型的分词,或计算基因组学和机器学习应用中的片段分析。

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gtex-database

K-Dense Inc.

查询GTEx(基因型-组织表达)门户,获取组织特异性基因表达、eQTLs(表达数量性状位点)和sQTLs。对于将GWAS变异与基因调控联系起来、理解组织特异性表达以及解读非编码变异的影响至关重要。

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gwas-database

K-Dense Inc.

查询NHGRI-EBI GWAS目录中的SNP与性状关联信息。通过rs编号、疾病/性状或基因搜索变异,获取P值和汇总统计量,用于遗传流行病学和多基因风险评分。

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hedgefundmonitor

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查询金融研究办公室(OFR)对冲基金监测API,获取对冲基金数据,包括SEC PF表格的聚合统计、商品期货交易委员会(CFTC)金融期货交易者数据、FICC支持的回购交易量以及美联储SCOOS交易商融资条款。获取对冲基金规模、杠杆率、交易对手、流动性、复杂性和风险管理的时间序列数据。无需API密钥或注册。适用于处理对冲基金数据、系统性风险监控、金融稳定研究、对冲基金杠杆或杠杆比率、交易对手集中度、PF表格统计、回购市场数据或OFR金融研究数据。

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histolab

K-Dense Inc.

轻量级 WSI 切片提取与预处理。适用于基础切片处理,如组织检测、切片提取和 H&E 图像的染色归一化。最适合简单流程、数据集准备和快速基于切片的分析。如需进行高级空间蛋白质组学、多重成像或深度学习流程,请使用 pathml。

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