快速通过 CLI/Python 查询 20 多个生物信息学数据库，用于快速查找：基因信息、BLAST 搜索、AlphaFold 结构、富集分析。最适合交互式探索和简单查询。如需批处理或高级 BLAST 功能，请使用 Biopython；如需多数据库 Python 工作流，请使用 Bioservices。

在Ginkgo Bioworks云实验室（cloud.ginkgo.bio）上提交和管理协议，该平台是一个基于网页的界面，用于在可重构自动化推车（RACs）上实现自主实验。当用户需要运行无细胞蛋白质表达（验证或优化）、生成荧光像素艺术或与Ginkgo云实验室服务交互时使用。涵盖协议选择、输入准备、定价和订购流程。

查询gnomAD（基因组聚集数据库）以获取人群等位基因频率、变异约束评分（pLI、LOEUF）及功能丧失不耐受信息。对于变异致病性解读、罕见病遗传学研究以及识别功能丧失不耐受基因至关重要。

查询GTEx（基因型-组织表达）门户，获取组织特异性基因表达、eQTLs（表达数量性状位点）和sQTLs。对于将GWAS变异与基因调控联系起来、理解组织特异性表达以及解读非编码变异的影响至关重要。

查询NHGRI-EBI GWAS目录中的SNP与性状关联信息。通过rs编号、疾病/性状或基因搜索变异，获取P值和汇总统计量，用于遗传流行病学和多基因风险评分。

轻量级 WSI 切片提取与预处理。适用于基础切片处理，如组织检测、切片提取和 H&E 图像的染色归一化。最适合简单流程、数据集准备和快速基于切片的分析。如需进行高级空间蛋白质组学、多重成像或深度学习流程，请使用 pathml。

访问人类代谢组数据库（22万多种代谢物）。通过名称/ID/结构进行搜索，获取化学性质、生物标志物数据、NMR/MS谱图和代谢通路，用于代谢组学分析与鉴定。

查询InterPro以获取蛋白质家族、结构域和功能位点的注释。整合了Pfam、PANTHER、PRINTS、SMART、SUPERFAMILY及其他11个成员数据库。适用于蛋白质功能预测、结构域架构分析、进化分类和GO术语映射。

查询JASPAR以获取转录因子结合位点（TFBS）特征（PWMs/PFMs）。可通过转录因子名称、物种或类别进行搜索；扫描DNA序列以查找转录因子结合位点；比较基质矩阵；对调控基因组学、基序分析和GWAS调控变异解释至关重要。