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biopython

K-Dense Inc.

全面的分子生物学工具包。用于序列操作、文件解析(FASTA/GenBank/PDB)、系统发育分析以及编程访问NCBI/PubMed(Bio.Entrez)。最适合批量处理、自定义生物信息学流程和BLAST自动化。如需快速查询,请使用gget;如需多服务集成,请使用bioservices。

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bioservices

K-Dense Inc.

统一的 Python 接口,支持 40 多个生物信息学服务。在单个工作流中查询多个数据库(UniProt、KEGG、ChEMBL、Reactome)时使用,API 保持一致。最适合跨数据库分析和跨服务的 ID 映射。如需快速单数据库查询,请使用 gget;如需序列或文件操作,请使用 biopython。

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ensembl-database

K-Dense Inc.

查询Ensembl基因组数据库REST API,涵盖250多种物种,支持基因检索、序列获取、变异分析、比较基因组学、直系同源基因分析和VEP预测,适用于基因组研究。

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gene-database

K-Dense Inc.

通过E-utilities/Datasets API查询NCBI Gene。按符号/ID搜索,获取基因信息(RefSeq、GO、位置、表型),支持批量查询,用于基因注释和功能分析。

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gget

K-Dense Inc.

快速通过 CLI/Python 查询 20 多个生物信息学数据库,用于快速查找:基因信息、BLAST 搜索、AlphaFold 结构、富集分析。最适合交互式探索和简单查询。如需批处理或高级 BLAST 功能,请使用 Biopython;如需多数据库 Python 工作流,请使用 Bioservices。

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infographics

K-Dense Inc.

使用 Nano Banana Pro AI 创建专业信息图表,具备智能迭代优化功能。采用 Gemini 3 Pro 进行质量审查,整合研究检索与网页搜索以确保数据准确。支持 10 种信息图表类型、8 种行业风格,以及色盲安全配色方案。

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生成长达50页以上的综合性市场研究报告,风格媲美顶级咨询公司(麦肯锡、BCG、Gartner)。具备专业LaTeX排版、通过scientific-schematics和generate-image生成大量可视化图表、深度集成research-lookup进行数据收集,并运用多种战略分析框架,包括波特五力模型、PESTLE分析、SWOT分析、TAM/SAM/SOM分析以及波士顿矩阵。

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