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Research & Science v1.0.0

latex-posters

K-Dense Inc.

使用 beamerposter、tikzposter 或 baposter 在 LaTeX 中创建专业研究展板,支持学术会议展示、学术海报和科学交流。包含版式设计、配色方案、多栏格式、图表整合以及专为视觉传播设计的展板最佳实践。

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matchms

K-Dense Inc.

用于代谢组学的光谱相似性分析与化合物鉴定。适用于比较质谱、计算相似性得分(余弦相似度、修正余弦相似度)以及从光谱库中识别未知化合物。最适合代谢物鉴定、光谱匹配和库搜索。如需完整的LC-MS/MS蛋白组学分析流程,请使用pyopenms。

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matplotlib

K-Dense Inc.

低层级绘图库,支持完全自定义。当您需要对每个绘图元素进行精细控制、创建新型图表类型或与特定科学工作流集成时使用。可导出为 PNG/PDF/SVG 格式以供发表。如需快速生成统计图表,请使用 seaborn;如需交互式图表,请使用 plotly;如需符合期刊风格的出版级多面板图表,请使用 scientific-visualization。

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openalex-database

K-Dense Inc.

使用OpenAlex数据库查询和分析学术文献。当需要搜索学术论文、分析研究趋势、查找作者或机构的作品、追踪引用、发现开放获取出版物或对超过2.4亿篇学术作品进行文献计量分析时,请使用本技能。适用于文献检索、研究成果分析、引用分析和学术数据库查询。

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plotly

K-Dense Inc.

交互式可视化库。当您需要悬停信息、缩放、平移或可嵌入网页的图表时使用。最适合用于仪表盘、探索性分析和演示。如需静态出版图表,请使用 matplotlib 或科学可视化工具。

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pydicom

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用于处理DICOM(医学数字成像和通信)文件的Python库。当需要读取、写入或修改DICOM格式的医学影像数据,从医学影像(CT、MRI、X射线、超声)中提取像素数据,匿名化DICOM文件,处理DICOM元数据和标签,将DICOM图像转换为其他格式,处理压缩的DICOM数据,或处理医学影像数据集时,可使用此技能。适用于涉及医学影像分析、PACS系统、放射科工作流程和医疗影像应用的任务。

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pyhealth

K-Dense Inc.

用于开发、测试和部署临床数据机器学习模型的综合性医疗人工智能工具包。当处理电子健康记录(EHR)、临床预测任务(死亡率、再入院、药物推荐)、医学编码系统(ICD、NDC、ATC)、生理信号(EEG、ECG)、医疗数据集(MIMIC-III/IV、eICU、OMOP)或为医疗应用实现深度学习模型(如RETAIN、SafeDrug、Transformer、GNN)时,应使用此技能。

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pyopenms

K-Dense Inc.

完整的质谱分析平台,适用于蛋白质组学工作流程中的特征检测、肽段鉴定、蛋白质定量和复杂的液相色谱-串联质谱(LC-MS/MS)流程。支持多种文件格式和算法,最适合蛋白质组学和全面的质谱数据处理。如需简单的谱图比较或代谢物鉴定,请使用matchms。

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