一个用于处理地理空间矢量数据的 Python 库，支持 Shapefile、GeoJSON 和 GeoPackage 文件。适用于进行地理数据分析、几何运算、坐标变换、空间连接、叠加分析、伪彩地图绘制，或任何涉及读取/写入/分析矢量地理数据的任务。支持 PostGIS 数据库、交互式地图，以及与 matplotlib、folium 和 cartopy 的集成。适用于缓冲区分析、数据集间空间连接、边界合并、数据裁剪、面积/距离计算、坐标系重投影、地图绘制，以及在不同空间文件格式间转换等任务。

快速通过 CLI/Python 查询 20 多个生物信息学数据库，用于快速查找：基因信息、BLAST 搜索、AlphaFold 结构、富集分析。最适合交互式探索和简单查询。如需批处理或高级 BLAST 功能，请使用 Biopython；如需多数据库 Python 工作流，请使用 Bioservices。

查询gnomAD（基因组聚集数据库）以获取人群等位基因频率、变异约束评分（pLI、LOEUF）及功能丧失不耐受信息。对于变异致病性解读、罕见病遗传学研究以及识别功能丧失不耐受基因至关重要。

查询GTEx（基因型-组织表达）门户，获取组织特异性基因表达、eQTLs（表达数量性状位点）和sQTLs。对于将GWAS变异与基因调控联系起来、理解组织特异性表达以及解读非编码变异的影响至关重要。

查询NHGRI-EBI GWAS目录中的SNP与性状关联信息。通过rs编号、疾病/性状或基因搜索变异，获取P值和汇总统计量，用于遗传流行病学和多基因风险评分。

访问人类代谢组数据库（22万多种代谢物）。通过名称/ID/结构进行搜索，获取化学性质、生物标志物数据、NMR/MS谱图和代谢通路，用于代谢组学分析与鉴定。

查询InterPro以获取蛋白质家族、结构域和功能位点的注释。整合了Pfam、PANTHER、PRINTS、SMART、SUPERFAMILY及其他11个成员数据库。适用于蛋白质功能预测、结构域架构分析、进化分类和GO术语映射。

查询JASPAR以获取转录因子结合位点（TFBS）特征（PWMs/PFMs）。可通过转录因子名称、物种或类别进行搜索；扫描DNA序列以查找转录因子结合位点；比较基质矩阵；对调控基因组学、基序分析和GWAS调控变异解释至关重要。

仅供学术用途的KEGG直接REST API访问。提供通路分析、基因-通路映射、代谢通路、药物相互作用和ID转换功能。对于涉及多个数据库的Python工作流，建议使用bioservices；本工具适用于直接HTTP/REST操作或需要对KEGG进行特定控制的场景。