以编程方式查询CELLxGENE Census（6100万+细胞）。当您需要从最大规模的 curated 单细胞图谱中获取跨组织、疾病或细胞类型的表达数据时使用。适用于大规模群体查询和参考图谱比较。如需分析您自己的数据，请使用 scanpy 或 scvi-tools。

查询GTEx（基因型-组织表达）门户，获取组织特异性基因表达、eQTLs（表达数量性状位点）和sQTLs。对于将GWAS变异与基因调控联系起来、理解组织特异性表达以及解读非编码变异的影响至关重要。

轻量级 WSI 切片提取与预处理。适用于基础切片处理，如组织检测、切片提取和 H&E 图像的染色归一化。最适合简单流程、数据集准备和快速基于切片的分析。如需进行高级空间蛋白质组学、多重成像或深度学习流程，请使用 pathml。

此技能适用于使用LaminDB——一种开源的生物学数据框架，可使数据具备可查询性、可追溯性、可重复性和FAIR原则。适用于管理生物学数据集（如单细胞RNA测序、空间转录组、流式细胞术等）、跟踪计算工作流、使用生物学本体论对数据进行整理与验证、构建数据湖仓，以及确保生物学研究中的数据溯源与可重复性。涵盖数据管理、注释、本体论（基因、细胞类型、疾病、组织）、模式验证、与工作流管理工具（Nextflow、Snakemake）及MLOps平台（Weights & Biases、MLflow）的集成，以及部署策略。

功能全面的计算病理学工具包，适用于高级WSI分析，包括多重免疫荧光（CODEX、Vectra）、细胞核分割、组织图构建以及病理数据的机器学习模型训练。支持160多种切片格式。如需从H&E切片中简单提取图像块，histolab可能更便捷。