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Research & Science v1.0.0

scikit-survival

K-Dense Inc.

使用scikit-survival库在Python中进行生存分析和事件发生时间建模的综合工具包。当处理删失生存数据、执行事件发生时间分析、拟合Cox模型、随机生存森林、梯度提升模型或生存支持向量机、使用一致性指数或Brier评分评估生存预测、处理竞争风险,或使用scikit-survival库实现任何生存分析流程时,请使用此技能。

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scvelo

K-Dense Inc.

使用 scVelo 进行 RNA 速度分析:根据未剪接/剪接 mRNA 的动力学估算细胞状态转变,推断轨迹方向,计算潜在时间,并在单细胞 RNA-seq 数据中识别驱动基因。与 Scanpy/scVI-tools 相辅相成,用于轨迹推断。

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scvi-tools

K-Dense Inc.

用于单细胞组学的深度生成模型。当需要概率性批次校正(scVI)、迁移学习、带不确定性差异表达分析或多模态整合(TOTALVI、MultiVI)时使用。最适合高级建模、批次效应和多模态数据。标准分析流程请使用scanpy。

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seaborn

K-Dense Inc.

集成 pandas 的统计可视化工具,适用于快速探索分布、关系和分类比较,具备美观的默认设置。最适合绘制箱线图、小提琴图、配对图和热力图。基于 matplotlib 构建。如需交互式图表,请使用 plotly;如需出版级样式,请使用 scientific-visualization。

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shap

K-Dense Inc.

使用SHAP(SHapley Additive exPlanations)进行模型可解释性和可解释性分析。在解释机器学习模型预测、计算特征重要性、生成SHAP图(瀑布图、蜜蜂群图、条形图、散点图、力图、热力图)、调试模型、分析模型偏差或公平性、比较模型或实现可解释AI时使用此技能。适用于基于树的模型(XGBoost、LightGBM、随机森林)、深度学习(TensorFlow、PyTorch)、线性模型以及任何黑箱模型。

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simpy

K-Dense Inc.

基于过程的离散事件仿真框架(Python)。当构建包含流程、队列、资源及基于时间的事件的系统仿真时使用此技能,例如制造系统、服务运营、网络流量、物流或任何实体随时间与共享资源交互的系统。

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stable-baselines3

K-Dense Inc.

提供生产就绪的强化学习算法(PPO、SAC、DQN、TD3、DDPG、A2C),采用类似 scikit-learn 的 API,适用于标准强化学习实验、快速原型开发和文档完善的算法实现。最适合单智能体与 Gymnasium 环境结合使用。如需高性能并行训练、多智能体系统或自定义向量化环境,请改用 pufferlib。

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statistical-analysis

K-Dense Inc.

提供指导性的统计分析,包括测试选择与结果报告。适用于需要帮助选择适合的数据检验方法、检验假设、功效分析以及APA格式结果输出的场景,最适合学术研究结果报告和测试选择指导。如需编程实现特定模型,请使用statsmodels。

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statsmodels

K-Dense Inc.

Python 的统计模型库。当您需要特定模型类别(如 OLS、GLM、混合模型、ARIMA)并附带详细诊断、残差和推断时使用。最适合计量经济学、时间序列分析以及带有系数表格的严谨推断。如需在 APA 报告格式下进行引导式统计检验选择,请使用 statistical-analysis。

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