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imaging-data-commons

K-Dense Inc.

使用 idc-index 从 NCI 成像数据 Commons 查询和下载公开的癌症影像数据,用于访问大规模的放射学(CT、MR、PET)和病理学数据集,以进行人工智能训练或研究。无需身份验证,可通过元数据查询、在浏览器中可视化并查看许可证。

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infographics

K-Dense Inc.

使用 Nano Banana Pro AI 创建专业信息图表,具备智能迭代优化功能。采用 Gemini 3 Pro 进行质量审查,整合研究检索与网页搜索以确保数据准确。支持 10 种信息图表类型、8 种行业风格,以及色盲安全配色方案。

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interpro-database

K-Dense Inc.

查询InterPro以获取蛋白质家族、结构域和功能位点的注释。整合了Pfam、PANTHER、PRINTS、SMART、SUPERFAMILY及其他11个成员数据库。适用于蛋白质功能预测、结构域架构分析、进化分类和GO术语映射。

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lamindb

K-Dense Inc.

此技能适用于使用LaminDB——一种开源的生物学数据框架,可使数据具备可查询性、可追溯性、可重复性和FAIR原则。适用于管理生物学数据集(如单细胞RNA测序、空间转录组、流式细胞术等)、跟踪计算工作流、使用生物学本体论对数据进行整理与验证、构建数据湖仓,以及确保生物学研究中的数据溯源与可重复性。涵盖数据管理、注释、本体论(基因、细胞类型、疾病、组织)、模式验证、与工作流管理工具(Nextflow、Snakemake)及MLOps平台(Weights & Biases、MLflow)的集成,以及部署策略。

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literature-review

K-Dense Inc.

使用多个学术数据库(如PubMed、arXiv、bioRxiv、Semantic Scholar等)进行全方位、系统性的文献综述。此技能适用于开展系统性文献综述、元分析、研究整合或跨生物医学、科学与技术领域的全面文献检索。能够创建格式专业、引用经过核实的Markdown文档和PDF文件,支持多种引用格式(如APA、Nature、Vancouver等)。

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具备全面的 Markdown 和 Mermaid 图表编写能力,适用于创建任何科学文档、报告、分析或可视化内容。以文本化图表为默认文档标准,提供完整的样式指南(Markdown + Mermaid)、24 种图表类型参考及 9 种文档模板。

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matplotlib

K-Dense Inc.

低层级绘图库,支持完全自定义。当您需要对每个绘图元素进行精细控制、创建新型图表类型或与特定科学工作流集成时使用。可导出为 PNG/PDF/SVG 格式以供发表。如需快速生成统计图表,请使用 seaborn;如需交互式图表,请使用 plotly;如需符合期刊风格的出版级多面板图表,请使用 scientific-visualization。

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modal

K-Dense Inc.

在云端使用无服务器容器、GPU 和自动扩缩容运行 Python 代码。适用于部署机器学习模型、运行批处理任务、调度计算密集型任务,或提供需 GPU 加速或动态扩缩容的 API。

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