统一的 Python 接口,支持 40 多个生物信息学服务。在单个工作流中查询多个数据库(UniProt、KEGG、ChEMBL、Reactome)时使用,API 保持一致。最适合跨数据库分析和跨服务的 ID 映射。如需快速单数据库查询,请使用 gget;如需序列或文件操作,请使用 biopython。
统一的 Python 接口,支持 40 多个生物信息学服务。在单个工作流中查询多个数据库(UniProt、KEGG、ChEMBL、Reactome)时使用,API 保持一致。最适合跨数据库分析和跨服务的 ID 映射。如需快速单数据库查询,请使用 gget;如需序列或文件操作,请使用 biopython。
通过SOAP API访问BRENDA酶数据库,获取动力学参数(Km、kcat)、反应方程式、生物体数据以及底物特异性的酶信息,用于生化研究和代谢通路分析。
查询 cBioPortal 获取癌症基因组数据,包括数千项癌症研究中的体细胞突变、拷贝数变异、基因表达和生存数据,用于癌症靶点验证、癌基因/抑癌基因分析及患者层面的基因组谱分析。
为制药和临床研究环境生成专业的临床决策支持(CDS)文档,包括患者队列分析(按生物标志物分层并结合结局)和治疗推荐报告(基于证据的指南与决策算法)。支持GRADE证据分级、统计分析(风险比、生存曲线、瀑布图)、生物标志物整合及监管合规性。输出专为药物研发、临床研究和证据综合优化的可直接发表的LaTeX/PDF格式。
基于约束的代谢建模(COBRA)。用于系统生物学和代谢工程分析的FBA、FVA、基因敲除、流采样和SBML模型。
对任何问题、决策或创意挑战,开展多视角头脑理事会的审议。当用户需要多元观点、需要帮助做出艰难决策、要求进行委员会/专家组/董事会讨论、希望从多个角度探讨问题、请求反方观点分析,或说出“不同专家会如何看待这个问题”、“帮我从各方面思考一下”、“理事会模式”、“头脑理事会”或“对此进行审议”等话时,请使用此技能。当用户面临困境、权衡取舍或复杂选择且无明显答案时,也应触发此技能。
NGS分析工具包。支持BAM转bigWig、质量控制(相关性、PCA、指纹图谱)、热图/轮廓图(TSS、峰位),用于ChIP-seq、RNA-seq、ATAC-seq的可视化。
用于科学研究辅助的多智能体AI系统,可自动化从数据分析到论文发表的研究流程。当需要从数据集中生成研究想法、开发研究方法、执行计算实验、进行文献检索或生成符合发表要求的LaTeX格式论文时,应使用此功能。支持端到端研究流程,并提供可自定义的智能体编排。
访问并分析DrugBank数据库中的全面药物信息,包括药物性质、相互作用、靶点、通路、化学结构和药理数据。当处理药物数据、药物发现研究、药理学研究、药物-药物相互作用分析、靶点鉴定、化学相似性搜索、ADMET预测,或任何需要从DrugBank获取详细药物及药物靶点信息的任务时,应使用此功能。