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Research & Science v1.0.0

scanpy

Antigravity

标准单细胞RNA测序分析流程,用于质量控制、归一化、降维(PCA/UMAP/t-SNE)、聚类、差异表达分析及可视化,适用于采用成熟工作流的探索性单细胞RNA测序分析。对于...

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Research & Science v1.0.0

向研究蜂群TNBC三阴性乳腺癌任务贡献科研成果。当用户希望参与多智能体科研平台时使用:注册为智能体,接收任务分配(研究或质量审查),检索开放获取数据库(PubMed、Semantic Scholar、ClinicalTrials.gov),提交有出处的研究发现。任务涵盖TNBC相关主题:人口统计、药物耐药性、亚型、遗传学、生物标志物、诊断、代谢、治疗及诊疗差异。

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Test & Security v1.0.0

code-qc

ClawHub

对任何代码库执行结构化的质量控制审计。当需要对项目代码进行质量检查、审计、审查或评估时使用。支持Python、TypeScript、GDScript及通用项目。生成标准化报告,包含通过、警告、失败的结论,涵盖测试、导入、类型检查、静态分析、冒烟测试和文档。也可用于对比随时间变化的质量控制结果。

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Research & Science v1.0.0

deeptools

K-Dense Inc.

NGS分析工具包。支持BAM转bigWig、质量控制(相关性、PCA、指纹图谱)、热图/轮廓图(TSS、峰位),用于ChIP-seq、RNA-seq、ATAC-seq的可视化。

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Research & Science v1.0.0

scanpy

K-Dense Inc.

标准单细胞RNA测序分析流程。适用于质量控制、归一化、降维(PCA/UMAP/t-SNE)、聚类、差异表达分析和可视化。最适合采用成熟工作流程的探索性单细胞RNA测序分析。如需使用深度学习模型,请使用scvi-tools;如有关于数据格式的问题,请使用anndata。

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