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Research & Science v1.0.0

geomaster

K-Dense Inc.

涵盖遥感、GIS、空间分析、地球观测机器学习及30多个科学领域的综合地理空间科学技能。支持卫星影像处理(哨兵、陆地卫星、MODIS、SAR、高光谱)、矢量与栅格数据操作、空间统计、点云处理、网络分析、云原生工作流(STAC、COG、Planetary Computer),并支持8种编程语言(Python、R、Julia、JavaScript、C++、Java、Go、Rust),提供500多个代码示例。适用于遥感工作流、GIS分析、空间机器学习、地球观测数据处理、地形分析、水文建模、海洋空间分析、大气科学及任何地理空间计算任务。

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geopandas

K-Dense Inc.

一个用于处理地理空间矢量数据的 Python 库,支持 Shapefile、GeoJSON 和 GeoPackage 文件。适用于进行地理数据分析、几何运算、坐标变换、空间连接、叠加分析、伪彩地图绘制,或任何涉及读取/写入/分析矢量地理数据的任务。支持 PostGIS 数据库、交互式地图,以及与 matplotlib、folium 和 cartopy 的集成。适用于缓冲区分析、数据集间空间连接、边界合并、数据裁剪、面积/距离计算、坐标系重投影、地图绘制,以及在不同空间文件格式间转换等任务。

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gget

K-Dense Inc.

快速通过 CLI/Python 查询 20 多个生物信息学数据库,用于快速查找:基因信息、BLAST 搜索、AlphaFold 结构、富集分析。最适合交互式探索和简单查询。如需批处理或高级 BLAST 功能,请使用 Biopython;如需多数据库 Python 工作流,请使用 Bioservices。

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gtars

K-Dense Inc.

一个用 Rust 编写的高性能基因组区间分析工具包,附带 Python 绑定。适用于处理基因组区域、BED 文件、覆盖度轨迹、重叠检测、机器学习模型的分词,或计算基因组学和机器学习应用中的片段分析。

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histolab

K-Dense Inc.

轻量级 WSI 切片提取与预处理。适用于基础切片处理,如组织检测、切片提取和 H&E 图像的染色归一化。最适合简单流程、数据集准备和快速基于切片的分析。如需进行高级空间蛋白质组学、多重成像或深度学习流程,请使用 pathml。

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hypogenic

K-Dense Inc.

基于自动化大型语言模型的表格数据假设生成与验证。适用于系统性探索经验数据中模式的假设(例如,欺骗检测、内容分析)。结合文献洞察与数据驱动的假设检验。如需手动提出假设,请使用“假设生成”;如需创意构思,请使用“科学头脑风暴”。

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interpro-database

K-Dense Inc.

查询InterPro以获取蛋白质家族、结构域和功能位点的注释。整合了Pfam、PANTHER、PRINTS、SMART、SUPERFAMILY及其他11个成员数据库。适用于蛋白质功能预测、结构域架构分析、进化分类和GO术语映射。

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专为医疗器械质量管理体系ISO 13485认证文件准备的综合工具包。当用户需要协助完成ISO 13485 QMS文件工作时使用,包括:(1)对现有文件进行差距分析;(2)编制质量手册;(3)制定所需程序和作业指导书;(4)准备医疗器械档案;(5)理解ISO 13485要求;或(6)识别医疗器械认证所需的缺失文件。当用户提及医疗器械法规、QMS认证、FDA QMSR、欧盟MDR,或需要协助编制质量体系文件时,也请使用本工具包。

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jaspar-database

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查询JASPAR以获取转录因子结合位点(TFBS)特征(PWMs/PFMs)。可通过转录因子名称、物种或类别进行搜索;扫描DNA序列以查找转录因子结合位点;比较基质矩阵;对调控基因组学、基序分析和GWAS调控变异解释至关重要。

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