Benchling 研发平台集成：通过 API 访问注册表（DNA、蛋白质）、库存、ELN 条目和工作流，构建 Benchling 应用，查询数据仓库，实现实验室数据管理自动化。

DNAnexus 云基因组学平台。构建应用程序/小程序、管理数据（上传/下载）、使用 dxpy Python SDK、运行工作流，支持 FASTQ/BAM/VCF 格式，用于基因组学管道的开发与执行。

此技能适用于处理基因组区间数据（BED文件）的机器学习任务，可用于训练区域嵌入（Region2Vec、BEDspace）、单细胞ATAC-seq分析（scEmbed）、构建一致峰（universes）或任何基于机器学习的基因组区域分析。适用于BED文件集合、scATAC-seq数据、染色质可及性数据集以及基于区域的基因组特征学习。

此技能适用于使用LaminDB——一种开源的生物学数据框架，可使数据具备可查询性、可追溯性、可重复性和FAIR原则。适用于管理生物学数据集（如单细胞RNA测序、空间转录组、流式细胞术等）、跟踪计算工作流、使用生物学本体论对数据进行整理与验证、构建数据湖仓，以及确保生物学研究中的数据溯源与可重复性。涵盖数据管理、注释、本体论（基因、细胞类型、疾病、组织）、模式验证、与工作流管理工具（Nextflow、Snakemake）及MLOps平台（Weights & Biases、MLflow）的集成，以及部署策略。