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Research & Science v1.0.0

pptx-posters

K-Dense Inc.

使用 HTML/CSS 创建研究海报,并可导出为 PDF 或 PPTX 格式。仅在用户明确要求 PowerPoint/PPTX 海报格式时使用此功能。标准研究海报请使用 latex-posters。此功能提供现代化的网页端海报设计,支持响应式布局和便捷的视觉整合。

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primekg

K-Dense Inc.

查询精准医学知识图谱(PrimeKG),获取包括基因、药物、疾病、表型等在内的多尺度生物数据。

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Research & Science v1.0.0

与 protocols.io API 集成,用于管理科学实验方案。当需要与 protocols.io 配合进行方案搜索、创建、更新或发布,管理方案步骤与材料,处理讨论与评论,组织工作区,上传与管理文件,或将 protocols.io 功能整合到工作流程中时,请使用此技能。适用于方案发现、协作式方案开发、实验跟踪、实验室方案管理及科学文档管理。

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pubchem-database

K-Dense Inc.

通过 PUG-REST API/PubChemPy 查询 PubChem(1.1 亿多种化合物)。按名称/CID/SMILES 搜索,获取物性、相似性/子结构搜索、生物活性等信息,用于化学信息学。

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pubmed-database

K-Dense Inc.

直接通过 REST API 访问 PubMed。支持高级布尔/MeSH 查询、E-utilities API、批量处理和引文管理。适用于 Python 工作流时,建议使用 BioPython(Bio.Entrez)。本工具适用于直接的 HTTP/REST 操作或自定义 API 实现。

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pufferlib

K-Dense Inc.

专为速度和扩展性优化的高性能强化学习框架。当您需要快速并行训练、向量化环境、多智能体系统或与游戏环境(Atari、Procgen、NetHack)集成时,请使用本框架。相比标准实现,速度提升可达2至10倍。如需快速原型设计或需要详尽文档的标准算法实现,请改用stable-baselines3。

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pydeseq2

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差异基因表达分析(Python DESeq2)。从批量RNA-seq计数中识别差异表达基因,使用Wald检验、FDR校正,生成火山图和MA图,用于RNA-seq分析。

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pydicom

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用于处理DICOM(医学数字成像和通信)文件的Python库。当需要读取、写入或修改DICOM格式的医学影像数据,从医学影像(CT、MRI、X射线、超声)中提取像素数据,匿名化DICOM文件,处理DICOM元数据和标签,将DICOM图像转换为其他格式,处理压缩的DICOM数据,或处理医学影像数据集时,可使用此技能。适用于涉及医学影像分析、PACS系统、放射科工作流程和医疗影像应用的任务。

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pyhealth

K-Dense Inc.

用于开发、测试和部署临床数据机器学习模型的综合性医疗人工智能工具包。当处理电子健康记录(EHR)、临床预测任务(死亡率、再入院、药物推荐)、医学编码系统(ICD、NDC、ATC)、生理信号(EEG、ECG)、医疗数据集(MIMIC-III/IV、eICU、OMOP)或为医疗应用实现深度学习模型(如RETAIN、SafeDrug、Transformer、GNN)时,应使用此技能。

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