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Data AI v1.0.0

chemistry-query

ClawHub

用于PubChem API查询的化学试剂技能(化合物信息与属性、结构/SMILES/图像、合成路径/参考文献)+ RDKit化学信息学(SMILES转分子属性/logP/TPSA、2D PNG/SVG可视化、Morgan指纹、逆合成/BRICS断开、多步合成规划)。适用于涉及化合物、分子、结构、PubChem数据、RDKit分析、SMILES处理、合成路径、逆合成和反应模拟的化学任务。触发词包括:化学、化合物、分子、化学数据/属性、PubChem、RDKit、SMILES、结构、合成、反应、逆合成、合成计划/路径。

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datamol

K-Dense Inc.

基于RDKit的Python风格封装,提供简化接口和合理的默认设置,适用于标准药物发现流程,包括SMILES解析、标准化、描述符、指纹、聚类、3D构象和并行处理。返回原生的rdkit.Chem.Mol对象。如需高级控制或自定义参数,请直接使用RDKit。

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pubchem-database

K-Dense Inc.

通过 PUG-REST API/PubChemPy 查询 PubChem(1.1 亿多种化合物)。按名称/CID/SMILES 搜索,获取物性、相似性/子结构搜索、生物活性等信息,用于化学信息学。

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rdkit

K-Dense Inc.

用于精细分子控制的化学信息学工具包。支持SMILES/SDF解析、描述符(分子量、LogP、TPSA)、指纹、子结构搜索、二维/三维生成、相似性计算和反应分析。如需标准工作流及更简洁的界面,请使用datamol(基于RDKit的封装);如需高级控制、自定义净化或专用算法,请使用RDKit。

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