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kegg-database

K-Dense Inc.

仅供学术用途的KEGG直接REST API访问。提供通路分析、基因-通路映射、代谢通路、药物相互作用和ID转换功能。对于涉及多个数据库的Python工作流,建议使用bioservices;本工具适用于直接HTTP/REST操作或需要对KEGG进行特定控制的场景。

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lamindb

K-Dense Inc.

此技能适用于使用LaminDB——一种开源的生物学数据框架,可使数据具备可查询性、可追溯性、可重复性和FAIR原则。适用于管理生物学数据集(如单细胞RNA测序、空间转录组、流式细胞术等)、跟踪计算工作流、使用生物学本体论对数据进行整理与验证、构建数据湖仓,以及确保生物学研究中的数据溯源与可重复性。涵盖数据管理、注释、本体论(基因、细胞类型、疾病、组织)、模式验证、与工作流管理工具(Nextflow、Snakemake)及MLOps平台(Weights & Biases、MLflow)的集成,以及部署策略。

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latchbio-integration

K-Dense Inc.

生物信息学工作流的锁扣平台。使用 Latch SDK、@workflow/@task 装饰器构建流水线,部署无服务器工作流,支持 LatchFile/LatchDir,集成 Nextflow/Snakemake。

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latex-posters

K-Dense Inc.

使用 beamerposter、tikzposter 或 baposter 在 LaTeX 中创建专业研究展板,支持学术会议展示、学术海报和科学交流。包含版式设计、配色方案、多栏格式、图表整合以及专为视觉传播设计的展板最佳实践。

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literature-review

K-Dense Inc.

使用多个学术数据库(如PubMed、arXiv、bioRxiv、Semantic Scholar等)进行全方位、系统性的文献综述。此技能适用于开展系统性文献综述、元分析、研究整合或跨生物医学、科学与技术领域的全面文献检索。能够创建格式专业、引用经过核实的Markdown文档和PDF文件,支持多种引用格式(如APA、Nature、Vancouver等)。

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具备全面的 Markdown 和 Mermaid 图表编写能力,适用于创建任何科学文档、报告、分析或可视化内容。以文本化图表为默认文档标准,提供完整的样式指南(Markdown + Mermaid)、24 种图表类型参考及 9 种文档模板。

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生成长达50页以上的综合性市场研究报告,风格媲美顶级咨询公司(麦肯锡、BCG、Gartner)。具备专业LaTeX排版、通过scientific-schematics和generate-image生成大量可视化图表、深度集成research-lookup进行数据收集,并运用多种战略分析框架,包括波特五力模型、PESTLE分析、SWOT分析、TAM/SAM/SOM分析以及波士顿矩阵。

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markitdown

K-Dense Inc.

将文件和办公文档转换为 Markdown。支持 PDF、DOCX、PPTX、XLSX、图片(含 OCR)、音频(含转录)、HTML、CSV、JSON、XML、ZIP、YouTube 链接、EPub 等格式。

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