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Research & Science v1.0.0

adaptyv

K-Dense Inc.

用于自动化蛋白质检测与验证的云实验室平台。在设计蛋白质并需要实验验证时使用,包括结合实验、表达测试、热稳定性测量、酶活性测定或蛋白质序列优化。也可用于通过API提交实验、跟踪实验状态、下载结果、利用计算工具(NetSolP、SoluProt、SolubleMPNN、ESM)优化蛋白质序列以提高表达效率,或结合湿实验验证管理蛋白质设计流程。

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esm

K-Dense Inc.

一套全面的蛋白质语言模型工具包,包含ESM3(跨序列、结构和功能的生成性多模态蛋白质设计)和ESM C(高效蛋白质嵌入与表示)。在处理蛋白质序列、结构或功能预测、设计新型蛋白质、生成蛋白质嵌入、执行逆向折叠或开展蛋白质工程任务时使用此工具。支持本地模型使用和基于云的Forge API以实现可扩展推理。

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torchdrug

K-Dense Inc.

用于分子和蛋白质的PyTorch原生图神经网络。适用于构建自定义GNN架构以进行药物发现、蛋白质建模或知识图谱推理,特别适合自定义模型开发、蛋白质性质预测和逆合成分析。如需预训练模型和多种特征化工具,请使用DeepChem;如需基准数据集,请使用PyTDC。

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