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Data AI v1.0.0

uniprot-database

Antigravity

直接访问UniProt的REST API,支持蛋白质搜索、FASTA获取、ID映射以及Swiss-Prot/TrEMBL数据。对于涉及多个数据库的Python工作流,建议使用bioservices(提供40多种服务的统一接口)。本工具适用于直接的HTTP/REST操作或需要对UniProt进行精确控制的场景。

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Research & Science v1.0.0

biopython

K-Dense Inc.

全面的分子生物学工具包。用于序列操作、文件解析(FASTA/GenBank/PDB)、系统发育分析以及编程访问NCBI/PubMed(Bio.Entrez)。最适合批量处理、自定义生物信息学流程和BLAST自动化。如需快速查询,请使用gget;如需多服务集成,请使用bioservices。

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Research & Science v1.0.0

bioservices

K-Dense Inc.

统一的 Python 接口,支持 40 多个生物信息学服务。在单个工作流中查询多个数据库(UniProt、KEGG、ChEMBL、Reactome)时使用,API 保持一致。最适合跨数据库分析和跨服务的 ID 映射。如需快速单数据库查询,请使用 gget;如需序列或文件操作,请使用 biopython。

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Research & Science v1.0.0

gget

K-Dense Inc.

快速通过 CLI/Python 查询 20 多个生物信息学数据库,用于快速查找:基因信息、BLAST 搜索、AlphaFold 结构、富集分析。最适合交互式探索和简单查询。如需批处理或高级 BLAST 功能,请使用 Biopython;如需多数据库 Python 工作流,请使用 Bioservices。

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Research & Science v1.0.0

kegg-database

K-Dense Inc.

仅供学术用途的KEGG直接REST API访问。提供通路分析、基因-通路映射、代谢通路、药物相互作用和ID转换功能。对于涉及多个数据库的Python工作流,建议使用bioservices;本工具适用于直接HTTP/REST操作或需要对KEGG进行特定控制的场景。

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Research & Science v1.0.0

uniprot-database

K-Dense Inc.

直接访问UniProt的REST API,支持蛋白质搜索、FASTA获取、ID映射、Swiss-Prot/TrEMBL。对于涉及多个数据库的Python工作流,建议使用bioservices(统一接口,涵盖40多种服务)。如需直接进行HTTP/REST操作或对UniProt进行特定控制,请使用本工具。

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