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Research & Science v1.0.0

literature-review

K-Dense Inc.

使用多个学术数据库(如PubMed、arXiv、bioRxiv、Semantic Scholar等)进行全方位、系统性的文献综述。此技能适用于开展系统性文献综述、元分析、研究整合或跨生物医学、科学与技术领域的全面文献检索。能够创建格式专业、引用经过核实的Markdown文档和PDF文件,支持多种引用格式(如APA、Nature、Vancouver等)。

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monarch-database

K-Dense Inc.

查询Monarch Initiative知识图谱,获取跨物种的疾病-基因-表型关联。整合了OMIM、ORPHANET、HPO、ClinVar和模式生物数据库,适用于罕见病基因发现、表型到基因的映射、跨物种疾病建模以及HPO术语查询。

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openalex-database

K-Dense Inc.

使用OpenAlex数据库查询和分析学术文献。当需要搜索学术论文、分析研究趋势、查找作者或机构的作品、追踪引用、发现开放获取出版物或对超过2.4亿篇学术作品进行文献计量分析时,请使用本技能。适用于文献检索、研究成果分析、引用分析和学术数据库查询。

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pdb-database

K-Dense Inc.

访问 RCSB PDB 获取三维蛋白质/核酸结构。通过文本、序列或结构进行搜索,下载坐标(PDB/mmCIF),检索元数据,用于结构生物学和药物发现。

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pubchem-database

K-Dense Inc.

通过 PUG-REST API/PubChemPy 查询 PubChem(1.1 亿多种化合物)。按名称/CID/SMILES 搜索,获取物性、相似性/子结构搜索、生物活性等信息,用于化学信息学。

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pubmed-database

K-Dense Inc.

直接通过 REST API 访问 PubMed。支持高级布尔/MeSH 查询、E-utilities API、批量处理和引文管理。适用于 Python 工作流时,建议使用 BioPython(Bio.Entrez)。本工具适用于直接的 HTTP/REST 操作或自定义 API 实现。

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