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Research & Science v1.0.0

lamindb

K-Dense Inc.

此技能适用于使用LaminDB——一种开源的生物学数据框架,可使数据具备可查询性、可追溯性、可重复性和FAIR原则。适用于管理生物学数据集(如单细胞RNA测序、空间转录组、流式细胞术等)、跟踪计算工作流、使用生物学本体论对数据进行整理与验证、构建数据湖仓,以及确保生物学研究中的数据溯源与可重复性。涵盖数据管理、注释、本体论(基因、细胞类型、疾病、组织)、模式验证、与工作流管理工具(Nextflow、Snakemake)及MLOps平台(Weights & Biases、MLflow)的集成,以及部署策略。

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latex-posters

K-Dense Inc.

使用 beamerposter、tikzposter 或 baposter 在 LaTeX 中创建专业研究展板,支持学术会议展示、学术海报和科学交流。包含版式设计、配色方案、多栏格式、图表整合以及专为视觉传播设计的展板最佳实践。

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literature-review

K-Dense Inc.

使用多个学术数据库(如PubMed、arXiv、bioRxiv、Semantic Scholar等)进行全方位、系统性的文献综述。此技能适用于开展系统性文献综述、元分析、研究整合或跨生物医学、科学与技术领域的全面文献检索。能够创建格式专业、引用经过核实的Markdown文档和PDF文件,支持多种引用格式(如APA、Nature、Vancouver等)。

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Research & Science v1.0.0

具备全面的 Markdown 和 Mermaid 图表编写能力,适用于创建任何科学文档、报告、分析或可视化内容。以文本化图表为默认文档标准,提供完整的样式指南(Markdown + Mermaid)、24 种图表类型参考及 9 种文档模板。

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生成长达50页以上的综合性市场研究报告,风格媲美顶级咨询公司(麦肯锡、BCG、Gartner)。具备专业LaTeX排版、通过scientific-schematics和generate-image生成大量可视化图表、深度集成research-lookup进行数据收集,并运用多种战略分析框架,包括波特五力模型、PESTLE分析、SWOT分析、TAM/SAM/SOM分析以及波士顿矩阵。

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matlab

K-Dense Inc.

用于矩阵运算、数据分析、可视化和科学计算的MATLAB和GNU Octave数值计算。在编写涉及线性代数、信号处理、图像处理、微分方程、优化、统计或科学可视化的MATLAB/Octave脚本时使用。当用户需要帮助理解MATLAB语法、函数,或希望在MATLAB和Python代码之间进行转换时,也可使用。脚本可在MATLAB或开源的GNU Octave解释器中运行。

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matplotlib

K-Dense Inc.

低层级绘图库,支持完全自定义。当您需要对每个绘图元素进行精细控制、创建新型图表类型或与特定科学工作流集成时使用。可导出为 PNG/PDF/SVG 格式以供发表。如需快速生成统计图表,请使用 seaborn;如需交互式图表,请使用 plotly;如需符合期刊风格的出版级多面板图表,请使用 scientific-visualization。

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monarch-database

K-Dense Inc.

查询Monarch Initiative知识图谱,获取跨物种的疾病-基因-表型关联。整合了OMIM、ORPHANET、HPO、ClinVar和模式生物数据库,适用于罕见病基因发现、表型到基因的映射、跨物种疾病建模以及HPO术语查询。

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