具备全面的 Markdown 和 Mermaid 图表编写能力，适用于创建任何科学文档、报告、分析或可视化内容。以文本化图表为默认文档标准，提供完整的样式指南（Markdown + Mermaid）、24 种图表类型参考及 9 种文档模板。

用于代谢组学的光谱相似性分析与化合物鉴定。适用于比较质谱、计算相似性得分（余弦相似度、修正余弦相似度）以及从光谱库中识别未知化合物。最适合代谢物鉴定、光谱匹配和库搜索。如需完整的LC-MS/MS蛋白组学分析流程，请使用pyopenms。

低层级绘图库，支持完全自定义。当您需要对每个绘图元素进行精细控制、创建新型图表类型或与特定科学工作流集成时使用。可导出为 PNG/PDF/SVG 格式以供发表。如需快速生成统计图表，请使用 seaborn；如需交互式图表，请使用 plotly；如需符合期刊风格的出版级多面板图表，请使用 scientific-visualization。

Google NotebookLM 的自托管开源替代品，支持AI驱动的研究与文档分析。适用于将研究资料整理成笔记本、导入多种内容来源（PDF、视频、音频、网页、Office文档），生成AI驱动的笔记与摘要，从研究内容创建多说话者播客，通过上下文感知AI与文档对话，利用全文和向量搜索跨材料检索，或运行自定义内容转换。支持包括OpenAI、Anthropic、Google、Ollama、Groq和Mistral在内的16种以上AI服务商，并通过自托管确保完全的数据隐私。

适用于 OT-2 和 Flex 机器人的官方 Opentrons 协议 API。在为 Opentrons 硬件编写协议并需要全面访问 Protocol API v2 功能时使用。最适合生产环境中的 Opentrons 协议，确保官方 API 兼容性。如需多供应商自动化或更广泛的设备控制，请使用 pylabrobot。

功能全面的计算病理学工具包，适用于高级WSI分析，包括多重免疫荧光（CODEX、Vectra）、细胞核分割、组织图构建以及病理数据的机器学习模型训练。支持160多种切片格式。如需从H&E切片中简单提取图像块，histolab可能更便捷。

深度研究与写作工具的核心技能：以完整段落形式撰写科学论文（严禁使用项目符号）。采用两阶段流程：（1）通过研究检索制作各部分提纲并列出关键点；（2）将提纲转化为连贯流畅的正文。遵循IMRAD结构，引用格式支持APA/AMA/Vancouver，包含图表，符合CONSORT/STROBE/PRISMA等报告规范，适用于研究论文及期刊投稿。