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Research & Science v1.0.0

pydicom

K-Dense Inc.

用于处理DICOM(医学数字成像和通信)文件的Python库。当需要读取、写入或修改DICOM格式的医学影像数据,从医学影像(CT、MRI、X射线、超声)中提取像素数据,匿名化DICOM文件,处理DICOM元数据和标签,将DICOM图像转换为其他格式,处理压缩的DICOM数据,或处理医学影像数据集时,可使用此技能。适用于涉及医学影像分析、PACS系统、放射科工作流程和医疗影像应用的任务。

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pylabrobot

K-Dense Inc.

供应商中立的实验室自动化框架。适用于控制多种设备类型(如Hamilton、Tecan、Opentrons、酶标仪、泵)或需要跨不同供应商实现统一编程的场景。最适合复杂工作流程、多供应商配置及仿真环境。若仅使用Opentrons设备且有官方API,采用opentrons-integration可能更简单。

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pyopenms

K-Dense Inc.

完整的质谱分析平台,适用于蛋白质组学工作流程中的特征检测、肽段鉴定、蛋白质定量和复杂的液相色谱-串联质谱(LC-MS/MS)流程。支持多种文件格式和算法,最适合蛋白质组学和全面的质谱数据处理。如需简单的谱图比较或代谢物鉴定,请使用matchms。

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pysam

K-Dense Inc.

基因组文件工具包。读取/写入SAM/BAM/CRAM比对结果、VCF/BCF变异、FASTA/FASTQ序列,提取区域,计算覆盖度,适用于NGS数据处理流程。

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pytdc

K-Dense Inc.

治疗数据commons:AI就绪的药物发现数据集(ADME、毒性、DTI)、基准测试、骨架拆分、分子预测模型,用于治疗学机器学习和药理预测。

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pyzotero

K-Dense Inc.

使用 pyzotero Python 客户端与 Zotero 参考文献管理库进行交互。通过 Zotero Web API v3 检索、创建、更新和删除条目、集合、标签和附件。在程序化处理 Zotero 库、管理参考文献、导出引文、搜索库内容、上传 PDF 附件或构建与 Zotero 集成的研究自动化工作流时使用此功能。

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qiskit

K-Dense Inc.

IBM 量子计算框架。适用于针对 IBM 量子硬件、使用 Qiskit Runtime 处理生产工作负载,或需要 IBM 优化工具的场景。最适合在 IBM 硬件上执行、量子误差缓解和企业级量子计算。如需使用谷歌硬件,请选用 Cirq;如需基于梯度的量子机器学习,请选用 PennyLane;如需开放量子系统仿真,请选用 QuTiP。

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qutip

K-Dense Inc.

用于开放量子系统的量子物理模拟库。适用于研究主方程、Lindblad动力学、退相干、量子光学或腔QED。最适合用于物理研究、开放系统动力学和教学模拟。不适用于基于电路的量子计算——如需量子算法和硬件执行,请使用Qiskit、Cirq或PennyLane。

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