使用 TileDB 高效存储和检索基因组变异数据,支持可扩展的 VCF/BCF 数据导入、增量样本添加、压缩存储、并行查询以及群体基因组学的导出功能。
使用 TileDB 高效存储和检索基因组变异数据,支持可扩展的 VCF/BCF 数据导入、增量样本添加、压缩存储、并行查询以及群体基因组学的导出功能。
图神经网络(PyG)。节点/图分类、链接预测、GCN、GAT、GraphSAGE、异构图、分子性质预测,适用于几何深度学习。
用于分子和蛋白质的PyTorch原生图神经网络。适用于构建自定义GNN架构以进行药物发现、蛋白质建模或知识图谱推理,特别适合自定义模型开发、蛋白质性质预测和逆合成分析。如需预训练模型和多种特征化工具,请使用DeepChem;如需基准数据集,请使用PyTDC。
在使用预训练的Transformer模型进行自然语言处理、计算机视觉、音频或多模态任务时,应使用此技能。适用于文本生成、分类、问答、翻译、摘要、图像分类、目标检测、语音识别以及在自定义数据集上微调模型。
直接访问UniProt的REST API,支持蛋白质搜索、FASTA获取、ID映射、Swiss-Prot/TrEMBL。对于涉及多个数据库的Python工作流,建议使用bioservices(统一接口,涵盖40多种服务)。如需直接进行HTTP/REST操作或对UniProt进行特定控制,请使用本工具。
UMAP 维度约简:用于 2D/3D 可视化和聚类预处理(HDBSCAN)的快速非线性流形学习,支持监督/参数化 UMAP,适用于高维数据。
查询美国财政部财政数据API,获取包括国家债务、政府支出、收入、利率、汇率和储蓄债券在内的联邦财务数据。无需API密钥即可访问54个数据集和182个数据表。适用于处理美国联邦财政数据、国家债务追踪(精确到美分)、每日财政部报表、月度财政部报表、财政部证券拍卖、 Treasury证券利率、外汇汇率、储蓄债券或任何美国政府财务统计数据。
使用此技能处理和分析超出可用内存的大型表格数据集(数十亿行)。Vaex 在外部存储 DataFrame 操作、惰性求值、快速聚合、大数据高效可视化以及大规模数据集的机器学习方面表现卓越。当用户需要处理大型 CSV/HDF5/Arrow/Parquet 文件、对海量数据集进行快速统计分析、创建大数据可视化图表,或构建无法完全装入内存的机器学习流水线时,适用于此场景。
当用户需要创建、读取、编辑或操作Word文档(.docx文件)时,请使用此技能。触发条件包括:提及“Word文档”、“word文档”、“.docx”,或要求生成带有目录、标题、页码、信头等格式的专业文档。在从.docx文件中提取或重新整理内容、插入或替换文档中的图片、在Word文件中执行查找与替换、处理修订标记或批注,或将内容转换为精美的Word文档时,也请使用此技能。如果用户要求以Word或.docx格式提供“报告”、“备忘录”、“信件”、“模板”或类似交付物,请使用此技能。请勿用于PDF、电子表格、Google文档,或与文档生成无关的通用编程任务。