用于开发、测试和部署临床数据机器学习模型的综合性医疗人工智能工具包。当处理电子健康记录(EHR)、临床预测任务(死亡率、再入院、药物推荐)、医学编码系统(ICD、NDC、ATC)、生理信号(EEG、ECG)、医疗数据集(MIMIC-III/IV、eICU、OMOP)或为医疗应用实现深度学习模型(如RETAIN、SafeDrug、Transformer、GNN)时,应使用此技能。
用于开发、测试和部署临床数据机器学习模型的综合性医疗人工智能工具包。当处理电子健康记录(EHR)、临床预测任务(死亡率、再入院、药物推荐)、医学编码系统(ICD、NDC、ATC)、生理信号(EEG、ECG)、医疗数据集(MIMIC-III/IV、eICU、OMOP)或为医疗应用实现深度学习模型(如RETAIN、SafeDrug、Transformer、GNN)时,应使用此技能。
使用 PyMC 进行贝叶斯建模:构建分层模型、MCMC(NUTS)、变分推断、LOO/WAIC 比较、后验检验,用于概率编程与推断。
标准单细胞RNA测序分析流程。适用于质量控制、归一化、降维(PCA/UMAP/t-SNE)、聚类、差异表达分析和可视化。最适合采用成熟工作流程的探索性单细胞RNA测序分析。如需使用深度学习模型,请使用scvi-tools;如有关于数据格式的问题,请使用anndata。
使用 scikit-learn 在 Python 中进行机器学习。适用于处理监督学习(分类、回归)、无监督学习(聚类、降维)、模型评估、超参数调优、数据预处理或构建机器学习流水线。提供算法、预处理技术、流水线和最佳实践的全面参考文档。
使用scikit-survival库在Python中进行生存分析和事件发生时间建模的综合工具包。当处理删失生存数据、执行事件发生时间分析、拟合Cox模型、随机生存森林、梯度提升模型或生存支持向量机、使用一致性指数或Brier评分评估生存预测、处理竞争风险,或使用scikit-survival库实现任何生存分析流程时,请使用此技能。
用于单细胞组学的深度生成模型。当需要概率性批次校正(scVI)、迁移学习、带不确定性差异表达分析或多模态整合(TOTALVI、MultiVI)时使用。最适合高级建模、批次效应和多模态数据。标准分析流程请使用scanpy。
使用SHAP(SHapley Additive exPlanations)进行模型可解释性和可解释性分析。在解释机器学习模型预测、计算特征重要性、生成SHAP图(瀑布图、蜜蜂群图、条形图、散点图、力图、热力图)、调试模型、分析模型偏差或公平性、比较模型或实现可解释AI时使用此技能。适用于基于树的模型(XGBoost、LightGBM、随机森林)、深度学习(TensorFlow、PyTorch)、线性模型以及任何黑箱模型。
提供指导性的统计分析,包括测试选择与结果报告。适用于需要帮助选择适合的数据检验方法、检验假设、功效分析以及APA格式结果输出的场景,最适合学术研究结果报告和测试选择指导。如需编程实现特定模型,请使用statsmodels。
Python 的统计模型库。当您需要特定模型类别(如 OLS、GLM、混合模型、ARIMA)并附带详细诊断、残差和推断时使用。最适合计量经济学、时间序列分析以及带有系数表格的严谨推断。如需在 APA 报告格式下进行引导式统计检验选择,请使用 statistical-analysis。