仅供学术用途的KEGG直接REST API访问。提供通路分析、基因-通路映射、代谢通路、药物相互作用和ID转换功能。对于涉及多个数据库的Python工作流，建议使用bioservices；本工具适用于直接HTTP/REST操作或需要对KEGG进行特定控制的场景。

具备全面的 Markdown 和 Mermaid 图表编写能力，适用于创建任何科学文档、报告、分析或可视化内容。以文本化图表为默认文档标准，提供完整的样式指南（Markdown + Mermaid）、24 种图表类型参考及 9 种文档模板。

生成长达50页以上的综合性市场研究报告，风格媲美顶级咨询公司（麦肯锡、BCG、Gartner）。具备专业LaTeX排版、通过scientific-schematics和generate-image生成大量可视化图表、深度集成research-lookup进行数据收集，并运用多种战略分析框架，包括波特五力模型、PESTLE分析、SWOT分析、TAM/SAM/SOM分析以及波士顿矩阵。

用于矩阵运算、数据分析、可视化和科学计算的MATLAB和GNU Octave数值计算。在编写涉及线性代数、信号处理、图像处理、微分方程、优化、统计或科学可视化的MATLAB/Octave脚本时使用。当用户需要帮助理解MATLAB语法、函数，或希望在MATLAB和Python代码之间进行转换时，也可使用。脚本可在MATLAB或开源的GNU Octave解释器中运行。

使用 OpenMM 和 MDAnalysis 运行并分析分子动力学模拟。搭建蛋白质/小分子体系，定义力场，执行能量最小化和分子动力学生产模拟，分析轨迹（RMSD、RMSF、接触图、自由能表面），适用于结构生物学、药物结合和生物物理学研究。

一个功能全面的工具包，用于在 Python 中创建、分析和可视化复杂网络与图。适用于处理网络/图数据结构、分析实体间的关联、计算图算法（最短路径、中心性、聚类）、检测社区结构、生成合成网络或可视化网络拓扑结构。适用于社交网络、生物网络、交通系统、引文网络以及任何涉及成对关系的领域。

用于分析包括心电图（ECG）、脑电图（EEG）、皮肤电活动（EDA）、呼吸信号（RSP）、光电容积脉搏波（PPG）、肌电图（EMG）和眼电图（EOG）在内的生理数据的综合性生物信号处理工具包。适用于处理心血管信号、脑活动、皮肤电反应、呼吸模式、肌肉活动或眼动。可用于心率变异性分析、事件相关电位、复杂性衡量、自主神经系统评估、心理生理学研究以及多模态生理信号的整合。

Neuropixels 神经记录分析。加载 SpikeGLX/OpenEphys 数据，进行预处理、运动校正、Kilosort4 神经元放电排序、质量评估、Allen/IBL 筛选、AI辅助视觉分析，适用于 Neuropixels 1.0/2.0 细胞外电生理学研究。在处理神经记录、放电排序、细胞外电生理数据，或用户提及 Neuropixels、SpikeGLX、Open Ephys、Kilosort、质量评估或单位筛选时使用。

显微镜数据管理平台。通过Python访问图像，获取数据集，分析像素，管理感兴趣区域/注释，支持批量处理，适用于高内涵筛选和显微镜工作流。