查询InterPro以获取蛋白质家族、结构域和功能位点的注释。整合了Pfam、PANTHER、PRINTS、SMART、SUPERFAMILY及其他11个成员数据库。适用于蛋白质功能预测、结构域架构分析、进化分类和GO术语映射。

查询JASPAR以获取转录因子结合位点（TFBS）特征（PWMs/PFMs）。可通过转录因子名称、物种或类别进行搜索；扫描DNA序列以查找转录因子结合位点；比较基质矩阵；对调控基因组学、基序分析和GWAS调控变异解释至关重要。

仅供学术用途的KEGG直接REST API访问。提供通路分析、基因-通路映射、代谢通路、药物相互作用和ID转换功能。对于涉及多个数据库的Python工作流，建议使用bioservices；本工具适用于直接HTTP/REST操作或需要对KEGG进行特定控制的场景。

此技能适用于使用LaminDB——一种开源的生物学数据框架，可使数据具备可查询性、可追溯性、可重复性和FAIR原则。适用于管理生物学数据集（如单细胞RNA测序、空间转录组、流式细胞术等）、跟踪计算工作流、使用生物学本体论对数据进行整理与验证、构建数据湖仓，以及确保生物学研究中的数据溯源与可重复性。涵盖数据管理、注释、本体论（基因、细胞类型、疾病、组织）、模式验证、与工作流管理工具（Nextflow、Snakemake）及MLOps平台（Weights & Biases、MLflow）的集成，以及部署策略。

使用多个学术数据库（如PubMed、arXiv、bioRxiv、Semantic Scholar等）进行全方位、系统性的文献综述。此技能适用于开展系统性文献综述、元分析、研究整合或跨生物医学、科学与技术领域的全面文献检索。能够创建格式专业、引用经过核实的Markdown文档和PDF文件，支持多种引用格式（如APA、Nature、Vancouver等）。

生成长达50页以上的综合性市场研究报告，风格媲美顶级咨询公司（麦肯锡、BCG、Gartner）。具备专业LaTeX排版、通过scientific-schematics和generate-image生成大量可视化图表、深度集成research-lookup进行数据收集，并运用多种战略分析框架，包括波特五力模型、PESTLE分析、SWOT分析、TAM/SAM/SOM分析以及波士顿矩阵。

用于矩阵运算、数据分析、可视化和科学计算的MATLAB和GNU Octave数值计算。在编写涉及线性代数、信号处理、图像处理、微分方程、优化、统计或科学可视化的MATLAB/Octave脚本时使用。当用户需要帮助理解MATLAB语法、函数，或希望在MATLAB和Python代码之间进行转换时，也可使用。脚本可在MATLAB或开源的GNU Octave解释器中运行。

通过 REST API 访问 NIH 代谢组学工作台（4,200 多项研究），查询代谢物、RefMet 命名法、MS/NMR 数据、m/z 搜索、研究元数据，用于代谢组学和生物标志物发现。

查询Monarch Initiative知识图谱，获取跨物种的疾病-基因-表型关联。整合了OMIM、ORPHANET、HPO、ClinVar和模式生物数据库，适用于罕见病基因发现、表型到基因的映射、跨物种疾病建模以及HPO术语查询。