通过 REST API 与 Paperless-ngx 文档管理系统交互,适用于用户在 Paperless-ngx 实例中搜索、上传、下载、整理文档,以及管理标签、对应方和文档类型。
通过 REST API 与 Paperless-ngx 文档管理系统交互,适用于用户在 Paperless-ngx 实例中搜索、上传、下载、整理文档,以及管理标签、对应方和文档类型。
查询Ensembl基因组数据库REST API,涵盖250多种物种,支持基因检索、序列获取、变异分析、比较基因组学、直系同源基因分析和VEP预测,适用于基因组研究。
仅供学术用途的KEGG直接REST API访问。提供通路分析、基因-通路映射、代谢通路、药物相互作用和ID转换功能。对于涉及多个数据库的Python工作流,建议使用bioservices;本工具适用于直接HTTP/REST操作或需要对KEGG进行特定控制的场景。
通过 REST API 访问 NIH 代谢组学工作台(4,200 多项研究),查询代谢物、RefMet 命名法、MS/NMR 数据、m/z 搜索、研究元数据,用于代谢组学和生物标志物发现。
通过 PUG-REST API/PubChemPy 查询 PubChem(1.1 亿多种化合物)。按名称/CID/SMILES 搜索,获取物性、相似性/子结构搜索、生物活性等信息,用于化学信息学。
直接通过 REST API 访问 PubMed。支持高级布尔/MeSH 查询、E-utilities API、批量处理和引文管理。适用于 Python 工作流时,建议使用 BioPython(Bio.Entrez)。本工具适用于直接的 HTTP/REST 操作或自定义 API 实现。
查询 Reactome REST API 以进行通路分析、富集分析、基因-通路映射、疾病通路、分子互作和表达分析,用于系统生物学研究。
直接访问UniProt的REST API,支持蛋白质搜索、FASTA获取、ID映射、Swiss-Prot/TrEMBL。对于涉及多个数据库的Python工作流,建议使用bioservices(统一接口,涵盖40多种服务)。如需直接进行HTTP/REST操作或对UniProt进行特定控制,请使用本工具。