查询 BindingDB 获取药物-靶标结合亲和力(Ki、Kd、IC50、EC50)的实测数据。可通过靶标(UniProt ID)、化合物(SMILES/名称)或病原体进行搜索。对药物发现、先导化合物优化、多靶点药理学分析及构效关系(SAR)研究至关重要。
查询 BindingDB 获取药物-靶标结合亲和力(Ki、Kd、IC50、EC50)的实测数据。可通过靶标(UniProt ID)、化合物(SMILES/名称)或病原体进行搜索。对药物发现、先导化合物优化、多靶点药理学分析及构效关系(SAR)研究至关重要。
查询ChEMBL生物活性分子和药物发现数据。通过结构/性质搜索化合物,获取生物活性数据(IC50、Ki),寻找抑制剂,进行药物化学的构效关系研究。
基于RDKit的Python风格封装,提供简化接口和合理的默认设置,适用于标准药物发现流程,包括SMILES解析、标准化、描述符、指纹、聚类、3D构象和并行处理。返回原生的rdkit.Chem.Mol对象。如需高级控制或自定义参数,请直接使用RDKit。
访问并分析DrugBank数据库中的全面药物信息,包括药物性质、相互作用、靶点、通路、化学结构和药理数据。当处理药物数据、药物发现研究、药理学研究、药物-药物相互作用分析、靶点鉴定、化学相似性搜索、ADMET预测,或任何需要从DrugBank获取详细药物及药物靶点信息的任务时,应使用此功能。
通过 REST API 访问 NIH 代谢组学工作台(4,200 多项研究),查询代谢物、RefMet 命名法、MS/NMR 数据、m/z 搜索、研究元数据,用于代谢组学和生物标志物发现。
查询Monarch Initiative知识图谱,获取跨物种的疾病-基因-表型关联。整合了OMIM、ORPHANET、HPO、ClinVar和模式生物数据库,适用于罕见病基因发现、表型到基因的映射、跨物种疾病建模以及HPO术语查询。
查询Open Targets平台,以获取靶标-疾病关联、药物靶标发现、可成药性/安全性数据、遗传学/组学证据、已知药物,用于治疗靶标识别。
访问 RCSB PDB 获取三维蛋白质/核酸结构。通过文本、序列或结构进行搜索,下载坐标(PDB/mmCIF),检索元数据,用于结构生物学和药物发现。
与 protocols.io API 集成,用于管理科学实验方案。当需要与 protocols.io 配合进行方案搜索、创建、更新或发布,管理方案步骤与材料,处理讨论与评论,组织工作区,上传与管理文件,或将 protocols.io 功能整合到工作流程中时,请使用此技能。适用于方案发现、协作式方案开发、实验跟踪、实验室方案管理及科学文档管理。