标准单细胞RNA测序分析流程，用于质量控制、归一化、降维（PCA/UMAP/t-SNE）、聚类、差异表达分析及可视化，适用于采用成熟工作流的探索性单细胞RNA测序分析。对于...

此技能适用于使用LaminDB——一种开源的生物学数据框架，可使数据具备可查询性、可追溯性、可重复性和FAIR原则。适用于管理生物学数据集（如单细胞RNA测序、空间转录组、流式细胞术等）、跟踪计算工作流、使用生物学本体论对数据进行整理与验证、构建数据湖仓，以及确保生物学研究中的数据溯源与可重复性。涵盖数据管理、注释、本体论（基因、细胞类型、疾病、组织）、模式验证、与工作流管理工具（Nextflow、Snakemake）及MLOps平台（Weights & Biases、MLflow）的集成，以及部署策略。

标准单细胞RNA测序分析流程。适用于质量控制、归一化、降维（PCA/UMAP/t-SNE）、聚类、差异表达分析和可视化。最适合采用成熟工作流程的探索性单细胞RNA测序分析。如需使用深度学习模型，请使用scvi-tools；如有关于数据格式的问题，请使用anndata。