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Research & Science v1.0.0

pubchem-database

K-Dense Inc.

通过 PUG-REST API/PubChemPy 查询 PubChem(1.1 亿多种化合物)。按名称/CID/SMILES 搜索,获取物性、相似性/子结构搜索、生物活性等信息,用于化学信息学。

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pubmed-database

K-Dense Inc.

直接通过 REST API 访问 PubMed。支持高级布尔/MeSH 查询、E-utilities API、批量处理和引文管理。适用于 Python 工作流时,建议使用 BioPython(Bio.Entrez)。本工具适用于直接的 HTTP/REST 操作或自定义 API 实现。

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pylabrobot

K-Dense Inc.

供应商中立的实验室自动化框架。适用于控制多种设备类型(如Hamilton、Tecan、Opentrons、酶标仪、泵)或需要跨不同供应商实现统一编程的场景。最适合复杂工作流程、多供应商配置及仿真环境。若仅使用Opentrons设备且有官方API,采用opentrons-integration可能更简单。

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pyzotero

K-Dense Inc.

使用 pyzotero Python 客户端与 Zotero 参考文献管理库进行交互。通过 Zotero Web API v3 检索、创建、更新和删除条目、集合、标签和附件。在程序化处理 Zotero 库、管理参考文献、导出引文、搜索库内容、上传 PDF 附件或构建与 Zotero 集成的研究自动化工作流时使用此功能。

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research-lookup

K-Dense Inc.

通过并行聊天API(主要)或Perplexity sonar-pro-search(学术论文搜索)查找最新的研究信息。自动将查询路由至最佳后端。用于查找论文、收集研究数据和验证科学信息。

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stable-baselines3

K-Dense Inc.

提供生产就绪的强化学习算法(PPO、SAC、DQN、TD3、DDPG、A2C),采用类似 scikit-learn 的 API,适用于标准强化学习实验、快速原型开发和文档完善的算法实现。最适合单智能体与 Gymnasium 环境结合使用。如需高性能并行训练、多智能体系统或自定义向量化环境,请改用 pufferlib。

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uniprot-database

K-Dense Inc.

直接访问UniProt的REST API,支持蛋白质搜索、FASTA获取、ID映射、Swiss-Prot/TrEMBL。对于涉及多个数据库的Python工作流,建议使用bioservices(统一接口,涵盖40多种服务)。如需直接进行HTTP/REST操作或对UniProt进行特定控制,请使用本工具。

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