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opentrons-integration

K-Dense Inc.

适用于 OT-2 和 Flex 机器人的官方 Opentrons 协议 API。在为 Opentrons 硬件编写协议并需要全面访问 Protocol API v2 功能时使用。最适合生产环境中的 Opentrons 协议,确保官方 API 兼容性。如需多供应商自动化或更广泛的设备控制,请使用 pylabrobot。

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pdb-database

K-Dense Inc.

访问 RCSB PDB 获取三维蛋白质/核酸结构。通过文本、序列或结构进行搜索,下载坐标(PDB/mmCIF),检索元数据,用于结构生物学和药物发现。

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perplexity-search

K-Dense Inc.

通过 LiteLLM 和 OpenRouter 使用 Perplexity 模型进行基于实时信息的 AI 驱动网页搜索。此功能适用于查找当前信息、检索近期科学文献、获取带有来源引用的可靠答案,或访问超出模型知识截止日期之外的信息。通过单一的 OpenRouter API 密钥,即可访问多个 Perplexity 模型,包括 Sonar Pro、Sonar Pro Search(高级代理搜索)和 Sonar Reasoning Pro。

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pubmed-database

K-Dense Inc.

直接通过 REST API 访问 PubMed。支持高级布尔/MeSH 查询、E-utilities API、批量处理和引文管理。适用于 Python 工作流时,建议使用 BioPython(Bio.Entrez)。本工具适用于直接的 HTTP/REST 操作或自定义 API 实现。

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uniprot-database

K-Dense Inc.

直接访问UniProt的REST API,支持蛋白质搜索、FASTA获取、ID映射、Swiss-Prot/TrEMBL。对于涉及多个数据库的Python工作流,建议使用bioservices(统一接口,涵盖40多种服务)。如需直接进行HTTP/REST操作或对UniProt进行特定控制,请使用本工具。

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usfiscaldata

K-Dense Inc.

查询美国财政部财政数据API,获取包括国家债务、政府支出、收入、利率、汇率和储蓄债券在内的联邦财务数据。无需API密钥即可访问54个数据集和182个数据表。适用于处理美国联邦财政数据、国家债务追踪(精确到美分)、每日财政部报表、月度财政部报表、财政部证券拍卖、 Treasury证券利率、外汇汇率、储蓄债券或任何美国政府财务统计数据。

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uspto-database

K-Dense Inc.

访问美国专利商标局(USPTO)API,用于专利/商标检索、审查历史(PEDS)、转让、引用、审查意见、TSDR,以进行知识产权分析和现有技术检索。

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venue-templates

K-Dense Inc.

获取主要科学出版平台(如《自然》、《科学》、PLOS、IEEE、ACM)、学术会议(如NeurIPS、ICML、CVPR、CHI)、研究展板及基金申请(如NSF、NIH、DOE、DARPA)的完整LaTeX模板、格式要求和投稿指南。当准备期刊投稿论文、会议论文、研究展板或基金申请时,如需遵循特定投稿平台的格式要求和模板,应使用此技能。

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zinc-database

K-Dense Inc.

访问ZINC(2.3亿多种可购买化合物)。通过ZINC ID/SMILES搜索、相似性搜索、可用于对接的三维结构、类似物发现,进行虚拟筛选和药物发现。

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