一个用于天文学和天体物理学的综合性Python库。在处理天文数据时使用该技能,包括天体坐标、物理单位、FITS文件、宇宙学计算、时间系统、表格、天球坐标系统(WCS)和天文数据分析。当任务涉及坐标变换、单位转换、FITS文件操作、宇宙学距离计算、时间尺度转换或天文数据处理时使用。
一个用于天文学和天体物理学的综合性Python库。在处理天文数据时使用该技能,包括天体坐标、物理单位、FITS文件、宇宙学计算、时间系统、表格、天球坐标系统(WCS)和天文数据分析。当任务涉及坐标变换、单位转换、FITS文件操作、宇宙学距离计算、时间尺度转换或天文数据处理时使用。
查询 cBioPortal 获取癌症基因组数据,包括数千项癌症研究中的体细胞突变、拷贝数变异、基因表达和生存数据,用于癌症靶点验证、癌基因/抑癌基因分析及患者层面的基因组谱分析。
访问ClinPGx药物基因组学数据(PharmGKB的后继者),查询基因-药物相互作用、CPIC指南和等位基因功能,以支持精准医学和基因型指导的给药决策。
在NCBI ClinVar中查询变异的临床意义。通过基因/位置搜索,解读致病性分类,通过E-utilities API或FTP访问,注释VCF文件,用于基因组医学。
与 Data Commons 平台合作,该平台提供对全球来源公共统计数据的程序化访问。在处理人口数据、经济指标、健康统计、环境数据或通过 Data Commons 可用的任何公共数据集时使用此技能。适用于查询人口统计信息、GDP 数据、失业率、疾病患病率、地理实体解析以及探索统计实体之间的关系。
DNAnexus 云基因组学平台。构建应用程序/小程序、管理数据(上传/下载)、使用 dxpy Python SDK、运行工作流,支持 FASTQ/BAM/VCF 格式,用于基因组学管道的开发与执行。
通过API/FTP访问欧洲核苷酸档案库,按 accession 获取DNA/RNA序列、原始测序数据(FASTQ)和基因组组装结果,用于基因组学和生物信息学流程。支持多种格式。
查询Ensembl基因组数据库REST API,涵盖250多种物种,支持基因检索、序列获取、变异分析、比较基因组学、直系同源基因分析和VEP预测,适用于基因组研究。
系统发育树工具包(ETE):支持树形结构操作(Newick/NHX)、进化事件检测、直系同源与旁系同源分析、NCBI分类学、可视化(PDF/SVG),适用于系统基因组学。