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latchbio-integration

K-Dense Inc.

生物信息学工作流的锁扣平台。使用 Latch SDK、@workflow/@task 装饰器构建流水线,部署无服务器工作流,支持 LatchFile/LatchDir,集成 Nextflow/Snakemake。

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pennylane

K-Dense Inc.

一种与硬件无关的量子机器学习框架,支持自动微分。适用于通过梯度训练量子电路、构建混合量子-经典模型,或需在IBM/Google/Rigetti/IonQ等设备间实现跨平台兼容的场景。最适合用于变分算法(VQE、QAOA)、量子神经网络,以及与PyTorch/JAX/TensorFlow的集成。如需针对特定硬件的优化,请使用Qiskit(IBM)或Cirq(Google);如需处理开放量子系统,请使用QuTiP。

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phylogenetics

K-Dense Inc.

使用MAFFT(多重序列比对)、IQ-TREE 2(最大似然法)和FastTree(快速NJ/ML)构建与分析系统发育树,并通过ETE3或FigTree进行可视化。适用于进化分析、微生物基因组学、病毒系统动力学、蛋白家族分析及分子钟研究。

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pymc

K-Dense Inc.

使用 PyMC 进行贝叶斯建模:构建分层模型、MCMC(NUTS)、变分推断、LOO/WAIC 比较、后验检验,用于概率编程与推断。

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pyzotero

K-Dense Inc.

使用 pyzotero Python 客户端与 Zotero 参考文献管理库进行交互。通过 Zotero Web API v3 检索、创建、更新和删除条目、集合、标签和附件。在程序化处理 Zotero 库、管理参考文献、导出引文、搜索库内容、上传 PDF 附件或构建与 Zotero 集成的研究自动化工作流时使用此功能。

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scientific-slides

K-Dense Inc.

为科研报告制作幻灯片和演示文稿。适用于制作PowerPoint幻灯片、会议报告、研讨会演讲、研究展示、论文答辩幻灯片或任何科学演讲。提供幻灯片结构、设计模板、时间安排指导和视觉验证功能,兼容PowerPoint和LaTeX Beamer。

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scikit-learn

K-Dense Inc.

使用 scikit-learn 在 Python 中进行机器学习。适用于处理监督学习(分类、回归)、无监督学习(聚类、降维)、模型评估、超参数调优、数据预处理或构建机器学习流水线。提供算法、预处理技术、流水线和最佳实践的全面参考文档。

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simpy

K-Dense Inc.

基于过程的离散事件仿真框架(Python)。当构建包含流程、队列、资源及基于时间的事件的系统仿真时使用此技能,例如制造系统、服务运营、网络流量、物流或任何实体随时间与共享资源交互的系统。

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torchdrug

K-Dense Inc.

用于分子和蛋白质的PyTorch原生图神经网络。适用于构建自定义GNN架构以进行药物发现、蛋白质建模或知识图谱推理,特别适合自定义模型开发、蛋白质性质预测和逆合成分析。如需预训练模型和多种特征化工具,请使用DeepChem;如需基准数据集,请使用PyTDC。

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